Son un grupo de especies y de ecosistemas (comunidad de organismos vivos y su medio ambiente) importantes, que han sido seleccionados por científicos para planificar la conservación de esta ecorregión.

Para ello se construyó un mapa de ecosistemas que reflejan la vegetación de las Yungas. De estos se seleccionaron los que tienen origen natural y se buscó conservarlos a lo largo de toda la ecorregión.

Así también se seleccionaron las especies de Anfibios, Reptiles, Aves y Mamíferos endémicas o en peligro de extinción y se generaron mapas de su distribución. Estos mapas sirvieron para conocer que lugares tienen mayor número de estas especies y por lo tanto son más importantes conservar.

En total se seleccionaron 319 especies de las cuales 94 son Anfibios, 29 son Reptiles, 140 son Aves y 56 son Mamíferos.